学院麻醉学研究所筹建于2009年7月，成立于2010年3月，2017年7月搬迁至科教大楼九号楼9楼，建筑面积1380平方米。麻醉学研究所是学院麻醉学专业硕士研究生培养实验活动主要建设平台，对全校及全市兄弟院校或单位提供平台共享、资源共享。

麻醉学研究所现设有6个主实验区：动物行为学及认知功能监测评估系列（整套）临时检测区；麻醉等临床药理、动物实时生理监护临时检测区；疼痛学、运动生理学临时检测区；细胞培养实验区；分子生物学实验区；生物化学、免疫化学实验区。

目前主要仪器设备有：小动物自主运动（跑轮）及监测评估系统、小动物认知功能监测及评估系统（Morris水迷宫、三箱社交、十字高架迷宫、旷场试验等）、爪痛觉测试仪、Von Frey机械痛测试仪、小动物实时生命监护系统、小动物麻醉机、CO₂恒温培养箱、PCR检测分析仪、凝胶成像系统、荧光倒置显微镜、高速冷冻离心机、酶标检测仪等等，能够满足麻醉、疼痛、神经、发育、细胞等多个临床或基础医学领域开展科学研究。

学院麻醉学系及麻醉学研究所多年来共聘请或邀请了英国帝国理工大学皇家医学院教授欧洲科学院院士马大青博士、香港大学李嘉诚医学院张志伟教授、荷兰马斯特里赫特大学Tatyana Strekalova教授等来校来所担任客座教授或进行学术访问，为我校麻醉学学科和麻醉学研究所的教学和科研发展提供了坚定的支持和帮助。